AB462324

From RiceWiki
Revision as of 01:31, 9 June 2014 by Zhangshoudong (talk | contribs) (References)
Jump to: navigation, search

Annotated Information

Function

常规信息

Pik-m 是稻瘟病抗性位点Pik 上的一个主效抗病等位基因,供体是Tsuyuake

基因的发现与命名

Kiyosawa 报道Minehikari 中含有一个与Pi-k 连锁的抗性基因Pi-m,但后来多个试验表明Pi-m 与Pi-k 等位,于是将Pi-m 重新命名为Pi-km (Kiyosawa, 1978)。

基因的定位

Pi-km 初步定位于水稻第11 染色体长臂近末端区域,SSR 标记RM254 和RM144 之间,遗传距离分别是13.4cM 和1.2cM;通过生物信息学分析,发展新的分子标记,最终精细定位在BAC克隆OSJNBa0036K13 内的84kb区间内(Li et al., 2007)。

基因克隆与生物学功能分析

序列分析和遗传互补实验表明,Pi-km 是由两个紧密连锁的具有独立功能NBS-LRR类基因(Pikm1-TS 和Pikm2-TS)组成。其中,Pikm1-TS 包含有62bp 5'-UTR、3432bp 编码区、2个内含子(119bp, 2769bp)和190bp 3'-UTR;Pikm2-TS 与Pikm1-TS 不同源,包含109bp 5'-UTR、3066bp 编码区、1个内含子(163bp)和283bp 3'-UTR(Ashikawa et al., 2008)。 Pikm1-TS 和Pikm2-TS 的编码产物均是NBS-LRR类抗病蛋白,长度分别为1143aa和1021aa。他们在结构上有些小的差异:Pikm1-TS 氨基端发现有nT基序,属于CC结构,而Pikm2-TS 虽也发现有nT基序,但未发现有CC结构;Pikm1-TS 羧基端有非LRR结构,而Pikm2-TS 没有(Ashikawa et al., 2008)。

备注

NBS-LRR 类抗病蛋白

Expression

Evolution

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

1. Stefano Costanzo;Yulin Jia,Sequence variation at the rice blast resistance gene Pi-km locus: Implications for the development of allele specific markers.Plant Science, 2010, 178(6): 523-530

2.Ikuo Ashikawa;Nagao Hayashi;Hiroko Yamane;Hiroyuki Kanamori;Jianzhong Wu;Takashi Matsumoto;Kazuko Ono;Masahiro Yano, Two Adjacent Nucleotide-Binding Site–Leucine-Rich Repeat Class Genes Are Required to Confer Pikm-Specific Rice Blast Resistance.Genetics, 2008, 180(4): 2267-2276

3. Luo-Ye Li;Ling Wang;Jin-Xue Jing;Zhen-Qi Li;Fei Lin;Li-Fei Huang;Qing-Hua Pan,The Pikm gene, conferring stable resistance to isolates of Magnaporthe oryzae, was finely mapped in a crossover-cold region on rice chromosome 11. Molecular Breeding, 2007, 20(2): 179-188

4. Shigehisa Kiyosawa,Identification of Blast-Resistance Genes in Some Rice Varieties.Japanese Journal of Breeding, 1978, 28(4): 287-296